У міру побудови водосховищ, стали виникати проблеми з течією. Воно сповільнилося, і вода стала сильно прогріватися. Значно більшою стала площа боліт. Це, своєю чергою викликало бурхливе зростання ціанобактерій і синьо-зелених водоростей.
Останнім часом, вони починають цвісти з травня.
Це дуже раннє цвітіння, як раз вказує на перегрітість водойми. Доходить до того, що поблизу Дніпра неможливо перебувати через нудотний запах. Взимку, в ході спуску води в греблях спостерігається масова загибель риби.
Ці проблеми дали знати про себе вже в 50-их роках минулого століття. Також річка потерпає від сільгосп-хімікатів та промислових стоків, побутового сміття по берегах, порушень правил забудови. У Дніпрі виявлено радіоактивні речовини.
Гідротехнічні споруди майже виробили свій ресурс експлуатації.
Через недостатнє фінансування вони занепадають і приходять в непридатність. У найближчому майбутньому ймовірність техногенної катастрофи з руйнуванням гребель досить висока.
